Publikationen

Im Rahmen unseres Sonderforschungsbereichs 1286 hat unser Forschungsteam zahlreiche Publikationen veröffentlicht. Alle Werke haben wir hier für Sie aufgelistet.

Ultrastructural Correlates of Presynaptic Functional Heterogeneity in Hippocampal Synapses

Lydia Maus, ChoongKu Lee, Bekir Altas, Sinem M. Sertel, Kirsten Weyand, Silvio O. Rizzoli, Jeong Seop Rhee, Nils Brose, Cordelia Imig, Benjamin H. Cooper

Veröffentlicht: 17. März 2020

https://doi.org/10.1016/j.celrep.2020.02.083

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Modeling the Shape of Synaptic Spines by Their Actin Dynamics

Mayte Bonilla-Quintana, Florentin Wörgötter, Christian Tetzlaff, Michael Fauth

geprüft: 24. Februar 2020

Veröffentlicht: 10. März 2020

https://doi.org/10.3389/fnsyn.2020.00009

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Kinetic coupling of the respiratory chain with ATP synthase, but not proton gradients, drives ATP production in cristae membranes

Alexandra Toth, Axel Meyrat, Stefan Stoldt, Ricardo Santiago, Dirk Wenzel, Stefan Jakobs, Christoph von Ballmoos, Martin Ott

geprüft: Dezember 2019

Veröffentlicht: 21. Januar 2020

https://doi.org/10.1073/pnas.1917968117

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Leaflet-dependent distribution of PtdIns`{`4,5`}`P2 in supported model membranes

Jonas Schäfer, Jessica Nehls, Markus Schön, Ingo P. Mey, Claudia Steinem
Veröffentlicht: 17. Januar 2020
https://doi.org/10.1162/netn_a_00086

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Realistic in silico generation and augmentation of single-cell RNA-seq data using generative adversarial networks

Mohamed Marouf, Pierre Machart, Vikas Bansal, Christoph Kilian, Daniel S. Magruder, Christian F. Krebs, Stefan Bonn

Erhalten: 25. August 2018; Genehmigt: 13. Dezember 2019;
Veröffentlicht:  9. Januar 2020.

https://doi.org/10.1038/s41467-019-14018-z

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2020

Explainable Deep Learning for Augmentation of Small RNA Expression Profiles

Jelena Fiosina, Maksims Fiosins, Stefan Bonn
Veröffentlicht: 18. Dezember 2019
https://doi.org/10.1162/netn_a_00086

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The long noncoding RNA neuroLNC regulates presynaptic activity by interacting with the neurodegeneration-associated protein TDP-43

S. Keihani, V. Kluever, S. Mandad, V. Bansal, R. Rahman, E. FritschL. Caldi GomesA. GärtnerS. KüglerH. Urlaub, J. D. WrenS. BonnS. O. Rizzoli, E. F. Fornasiero

Erhalten: 5. Juli 2019; Genehmigt: 23. Oktober 2019; Veröffentlicht: 18. Dezember 2019
https://doi.org/10.1126/sciadv.aay2670

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Live-cell STED nanoscopy of mitochondrial cristae

Till Stephan, Axel Roesch, Dietmar Riedel & Stefan Jakobs
Erhalten: 10. Juni 2019
Genehmigt: 13 August 2019
https://doi.org/10.1162/netn_a_00086

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Tagger—A Swiss army knife for multiomics to dissect cell type–specific mechanisms of gene expression in mice

Lech Kaczmarczyk, Vikas Bansal, Ashish Rajput, Raza-ur Rahman, Wiesław Krzyżak, Joachim Degen, Stefanie Poll, Martin Fuhrmann, Stefan Bonn, Walker Scot Jackso

Erhalten: 13. Mai 2019;  Genehmigt: 17. Juli 2019
Veröffentlicht: 8. August 2019
https://doi.org/10.1371/journal.pbio.3000374

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Correlative STED super-resolution light and electron microscopy on resin sections

Christian A Wurm, Heinz Schwarz, Daniel C. Jans, Dietmar Riedel, Bruno M. Humbel, Stefan Jakobs
Erhalten: 30. April 2019
Veröffentlicht: 16. Juli 2019
https://doi.org/10.1088/1361-6463/ab2b31

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Cytosolic Trapping of a Mitochondrial Heat Shock Protein Is an Early Pathological Event in Synucleinopathies

E ́ va M. Szego,  Antonio Dominguez-Meijide, Ellen Gerhardt, Annekatrin König, David J. Koss, Wen Li, Raquel Pinho, Christiane Fahlbusch, Mary Johnson, Patricia Santos, Anna Villar-Pique ́, Tobias Thom, Silvio Rizzoli, Matthias Schmitz, Jiayi Li, Inga Zerr, Johannes Attems, Olaf Jahn, Tiago F. Outeiro

Veröffentlicht: Juli 2019
https://doi.org/10.1016/j.celrep.2019.06.009

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Principles underlying the input-dependent formation and organization of memories

Juliane Herpich and Christian Tetzlaff
Veröffentlicht: 28. Mai 2019
https://doi.org/10.1162/netn_a_00086

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Deep Learning and Random Forest-Based Augmentation of sRNA Expression Profiles

Jelena Fiosina, Maksims Fiosins, Stefann Bonn
Veröffentlicht: 9. Mai 2019
https://doi.org/10.1162/netn_a_00086

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A Theoretical Framework to Derive Simple, Firing-Rate-Dependent Mathematical Models of Synaptic Plasticity

Janne Lappalainen, Juliane Herpich, Christian Tetzlaff

Erhalten: 26 November 2018; Genehmigt: 10 April 2019;
Veröffentlicht:  8. Mai  2019.

doi: 10.3389/fncom.2019.00026

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Fluorinated nanobodies for targeted molecular imaging of biological samples using nanoscale secondary ion mass spectrometry

Selda Kabatas, Paola Agüi-Gonzalez, ab Rena Hinrichs,
Sebastian Jähne, Felipe Opazo, ab Ulf Diederichsen, Silvio O. Rizzoli, Nhu T. Phan

Erhalten: 31. März  2019

Genehmigt: 24 April 2019

DOI: 10.1039/c9ja00117d

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2019

Robust nanoscopy of a synaptic protein in living mice by organic-fluorophore labeling

Jennifer-Magdalena Masch, Heinz Steffens, Joachim Fischer, Johann Engelhardt, Jasmine Hubrich, Jan Keller-Findeisen, Elisa D’Este, Nicolai T. Urban, Seth G. N. Grant, Steffen J. Sahl, Dirk Kamin, and Stefan W. Hell

PNAS August 21, 2018 115 (34) E8047-E8056; published ahead of print August 6, 2018

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Newly produced synaptic vesicle proteins are preferentially used in synaptic transmission

Truckenbrodt S, Viplav A, Jähne S, Vogts A, Denker A, Wildhagen H, Fornasiero EF, Rizzoli SO.
EMBO J. 2018 Aug 1;37(15). pii: e98044. doi: 10.15252/embj.201798044

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MINFLUX nanoscopy delivers 3D multicolor nanometer resolution in cells

Jennifer-Magdalena Masch, Heinz Steffens, Joachim Fischer, Johann Engelhardt, Jasmine Hubrich, Jan Keller-Findeisen, Elisa D’Este, Nicolai T. Urban, Seth G. N. Grant,Steffen J. Sahl, Dirk KaminStefan W. Hell
Veröffentlicht: 6. August 2018
https://doi.org/10.1073/pnas.1807104115

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Membrane binding, internalization, and sorting of alpha-synuclein in the cell

Caterina Masaracchia1, Marilena Hnida1, Ellen Gerhardt1, Tomás Lopes da Fonseca1, Anna Villar-Pique1, Tiago Branco3, Markus A. Stahlberg4, Camin Dean4, Claudio O. Fernández2, Ira Milosevic3and Tiago F. Outeiro1,5,6*

Masaracchia et al. Acta Neuropathologica Communications (2018) 6:79

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Circulating miRNAs as Diagnostic Biomarkers for Parkinson’s Disease

Isabel Paiva, Gaurav Jain, Diana F. Lázaro, Kristina Gotovac Jerčić, Thomas Hentrich, Cemil Kerimoglu, Raquel Pinho, Èva M. Szegő, Susanne Burkhardt, Vincenzo Capece, Rashi Halder, Rezaul Islam, Mary Xylaki, Lucas A. Caldi Gomes, Anna-Elisa Roser, Paul Lingor, Julia M. Schulze-Hentrich, Fran Borovečki, André Fischer, Tiago F. Outeiro

PII:S0969-9961(18)30392-9DOI: doi:10.1016/j.nbd.2018.08.001 Reference: YNBDI 4242

To appear in: Neurobiology of Disease Received date: 9 April 2018 Revised date: 12 July 2018 Accepted date: 3 August 2018

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Piccolo promotes vesicle replenishment at a fast central auditory synapse

Isabel Paiva, Gaurav Jain, Diana F. Lázaro, Kristina Gotovac Jerčić, Thomas Hentrich, Cemil Kerimoglu, Raquel Pinho, Èva M. Szegő, Susanne Burkhardt, Vincenzo Capece, Rashi Halder, Rezaul Islam, Mary Xylaki, Lucas A. Caldi Gomes, Anna-Elisa Roser, Paul Lingor, Julia M. Schulze-Hentrich, Fran Borovečki, André Fischer, Tiago F. Outeiro

PII:S0969-9961(18)30392-9DOI: doi:10.1016/j.nbd.2018.08.001 Reference: YNBDI 4242

To appear in: Neurobiology of Disease Received date: 9 April 2018 Revised date: 12 July 2018 Accepted date: 3 August 2018

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Sensing α-Synuclein From the Outside via the Prion Protein: Implications for Neurodegeneration

Inês Caldeira Brás, MSc,1 Luísa V. Lopes, PhD2 and Tiago Fleming Outeiro, PhD1,3,4,5*
Movement Disorders,2018
Received: 22 May 2018; Revised: 24 July 2018; Accepted: 26 July 2018 DOI: 10.1002/mds.27478

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Alpha-synuclein deregulates the expression of COL4A2 and impairs ER-Golgi function

Isabel Paiva, Gaurav Jain, Diana F. Lázaro, Kristina Gotovac Jerčić, Thomas Hentrich, Cemil Kerimoglu, Raquel Pinho, Èva M. Szegő, Susanne Burkhardt, Vincenzo Capece, Rashi Halder, Rezaul Islam, Mary Xylaki, Lucas A. Caldi Gomes, Anna-Elisa Roser, Paul Lingor, Julia M. Schulze-Hentrich, Fran Borovečki, André Fischer, Tiago F. Outeiro

PII:S0969-9961(18)30392-9DOI: doi:10.1016/j.nbd.2018.08.001 Reference: YNBDI 4242

To appear in: Neurobiology of Disease Received date: 9 April 2018 Revised date: 12 July 2018 Accepted date: 3 August 2018

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X10 expansion microscopy enables 25-nm resolution on conventional microscopes

Truckenbrodt S, Maidorn M, Crzan D, Wildhagen H, Kabatas S, Rizzoli SO.
EMBO Rep. 2018 Jul 9.

pii: e45836. doi: 10.15252/embr.201845836

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2018

Piccolo Promotes Vesicle Replenishment at a Fast Central Auditory Synapse

Tanvi Butola, Carolin Wichmann, Tobias Moser (2017)

Veröffentlicht 25. Oktober 2017

Front Synaptic Neurosci

doi.org/10.3389/fnsyn.2017.00014

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2017
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